Au travers de deux cas d’étude issus de l’archéologie préventive, cet article a pour objectif d’évaluer le potentiel bioarchéologique des micro-fossiles non-polliniques (MNP). Ils correspondent à des formes de résistance et de dissémination issus des cinq règnes du vivant. Associés à l’analyse des grains de pollen et des spores de végétaux, les premiers résultats obtenus sur les sites de Villeneuve-sur-Lot et de Lavau démontrent leur intérêt tant les informations qu’ils peuvent apporter sont nombreuses sur les plans paléoenvironnemental, paléoécologique, géoarchéologique ou taphonomique. Ces deux exemples arguent donc en faveur d’une analyse systématique de ces MNP en contexte archéologique comme c’est le cas pour les recherches palynologiques menées en contextes naturels.